Le nom Bénodet, « Benoded » en breton, vient directement du breton « Ben Oded » ou « Penn Oded » qui signifie « tête » (ou embouchure) de l'Odet, du nom du fleuve côtier qui arrose Quimper. De l'époque de la Préhistoire, seul le menhir de Poulquer subsiste. Le tumulus situé à Perguet sur la route de Bénodet a été fouillé en 1886. Ont été trouvés des débris d'urnes cinéraires. Le dolmen a quant à lui disparu. De l'époque romaine, des fouilles révèlent un établissement thermal ; certainement les prémices de la thalasso !